Đây là đơn vị cấp đại học đầu tiên tham gia kiểm định chất lượng chuẩn khu vực của Việt Nam. Quyết định trên của Đại học Quốc gia Hà Nội được đưa ra nhân kỳ họp thường niên của mạng lưới các trường Đại học Đông Nam Á (AUN) gồm đại diện lãnh đạo của gần 40 trường Đại học thuộc mạng lưới các trường Đại học Đông Nam Á và Nhật Bản, Trung Quốc, Hàn Quốc trong hai ngày 30, 31/3 tại Hà Nội.
AUN được thành lập tháng 11/1995 với 11 thành viên ban đầu đến từ 6 quốc gia khác nhau. Đến nay, AUN đã có 30 thành viên chính thức và 12 thành viên chưa chính thức đến từ 10 quốc gia trong khu vực Đông Nam Á. Ngoài Đại học Khoa học Tự nhiên, bốn chương trình đào tạo của ĐHQG Hà Nội cũng đã được đăng ký kiểm định năm 2015.
