UBND TP.HCM cho rằng việc lưu giữ gia súc sau khi có kết quả xét nghiệm định tính để chờ kết quả phân tích định lượng đã gặp nhiều bất cập, như nguy cơ phát sinh dịch bệnh rất lớn, diện tích chuồng lưu nhỏ hẹp, không có đủ trang thiết bị cho chăn nuôi. Đồng thời, việc lưu giữ kéo dài có thể gây cho gia súc mệt, chết và dễ xảy ra dịch bệnh dẫn đến phải xử lý. Thậm chí có tình trạng chủ cơ sở giết mổ, chủ nguồn gia súc né tránh thời gian kiểm dịch lâm sàng, không hợp tác với cơ quan thú y chăm sóc, bảo quản gia súc trong khi chờ kết quả xét nghiệm định lượng hoặc từ chối trách nhiệm lô hàng.
Trong thời gian qua, UBND TP đã chỉ đạo Sở NN&PTNT TP tiến hành các đợt kiểm tra thường xuyên và định kỳ về tình trạng sử dụng chất cấm tại các cơ sở chăn nuôi, cơ sở sản xuất, kinh doanh thức ăn chăn nuôi, cơ sở giết mổ, chợ đầu mối, chợ truyền thống trên địa bàn. Tình hình sử dụng chất cấm trong chăn nuôi đã có những chuyển biến tích cực, 11 tháng đầu năm 2015 chỉ có một trường hợp cơ sở chăn nuôi có sử dụng chất cấm, không phát hiện trường hợp sử dụng chất cấm tại cơ sở sản xuất, kinh doanh thức ăn chăn nuôi.