Theo Bộ GTVT, thực hiện đề án tái cơ cấu Tổng Công ty ĐSVN giai đoạn 2012-2015 được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt tại Quyết định 198/QĐ-TTg ngày 21-1-2013, trong những năm qua, Tổng Công ty ĐSVN đã thực hiện và đạt được những kết quả đáng ghi nhận như sắp xếp, đổi mới, tái cơ cấu các đơn vị và tổng công ty để đáp ứng được yêu cầu phát triển của ngành đường sắt, triển khai thực hiện các dự án đầu tư nhằm nâng cao chất lượng dịch vụ vận tải và hiệu quả kinh doanh của tổng công ty.
Trong thời gian qua, Thủ tướng Chính phủ đã có Quyết định 682/QĐ-TTg ngày 7-6-2012 phê duyệt Kế hoạch phát triển Tổng Công ty ĐSVN giai đoạn 2012-2015, Tổng Công ty ĐSVN đã tập trung nguồn lực để triển khai thực hiện các dự án đóng mới, nâng cấp các toa xe đạt được kết quả, đã đưa vào khai thác phục vụ nhu cầu của hành khách.
Hiện nay, Tổng Công ty ĐSVN đang phải thuê các toa hàng của đối tác để vận tải hàng hóa xuất nhập khẩu qua biên giới, Tổng Công ty ĐSVN có nhu cầu đầu tư thêm các toa hàng hóa và đã tổ chức khảo sát, nghiên cứu việc mua toa xe để có thể phục vụ cho nhu cầu trên.
Hiện nay một số toa tàu Việt Nam vẫn mua từ Trung Quốc.
Qua đánh giá của tổ công tác được thành lập theo Quyết định 480/QĐ-BGTVT ngày 15-2-2016 của Bộ GTVT nhận thấy: Tại Danh mục các dự án phát triển phương tiện đường sắt giai đoạn 2012-2015 kèm theo Quyết định 682/QĐ-TTg ngày 7-6-2012 của Thủ tướng Chính phủ, mục dự án đầu tư toa xe chỉ được đầu tư đóng mới toa xe, không có danh mục đầu tư toa xe đã qua sử dụng. Tuy nhiên, Tổng Công ty ĐSVN, Công ty TNHH MTV Vận tải đường sắt Hà Nội và các đơn vị có liên quan đã có chủ trương thực hiện việc khảo sát, nghiên cứu mua toa xe đã qua sử dụng khi chưa có sự chấp thuận của Thủ tướng Chính phủ và Bộ GTVT. Đồng thời, cung cấp thông tin cho cơ quan ngôn luận không đầy đủ, thiếu chính xác nên đã gây dư luận hiểu lầm, ảnh hưởng đến uy tín của ngành và Bộ GTVT.
Ngày 25-2-2016, lãnh đạo Bộ GTVT đã họp bàn và thống nhất, để thực hiện nghiêm các quy định của Nhà nước, Bộ GTVT sẽ thực hiện các quy trình thủ tục xem xét việc kỷ luật chủ tịch HĐTV Tổng Công ty ĐSVN trong việc chỉ đạo khảo sát, nghiên cứu đầu tư chưa đúng chủ trương của Thủ tướng Chính phủ. Yêu cầu HĐTV Tổng Công ty ĐSVN nghiêm túc tổ chức kiểm điểm, làm rõ trách nhiệm của HĐTV, ban lãnh đạo tổng công ty và các cán bộ có liên quan theo đúng chỉ đạo của Bộ GTVT tại Công văn 1484/BGTVT-TCCB ngày 3-2-2016 trước ngày 15-3-2016.
Trước đó, trả lời báo chí, Tổng Công ty ĐSVN cho biết đã giới thiệu hai đơn vị trong tổng công ty là Công ty Vận tải đường sắt Hà Nội và Công ty CP Vận tải và Thương mại đường sắt sang Trung Quốc khảo sát, tìm hiểu về tình trạng chất lượng kỹ thuật, giá trị còn lại và giá cả của các toa xe này để báo cáo Tổng Công ty ĐSVN xem xét cho chủ trương. Tuy nhiên, Tổng Công ty ĐSVN không có bất cứ văn bản nào cho phép đầu tư cũng như chấp thuận chủ trương đầu tư dự án nhập khẩu toa xe hàng của Trung Quốc đã qua sử dụng. Nhưng qua kết quả kiểm tra các vấn đề về mua, nhập khẩu toa xe đã qua sử dụng thời gian qua của Tổng Công ty ĐSVN đã phát hiện những sai phạm trên.
Liên quan đến vụ việc trên, Bộ trưởng Bộ GTVT Đinh La Thăng đã ký Văn bản 1484 chỉ đạo Tổng Công ty ĐSVN cho ông Nguyễn Viết Hiệp thôi làm người đại diện phần vốn nhà nước tại Công ty CP Vận tải đường sắt Hà Nội. Sau đó, Tổng Công ty ĐSVN họp, quyết định cách chức ông Nguyễn Viết Hiệp và điều động, bố trí làm phó trưởng ban Vận tải tổng công ty.