Hệ thống được xây dựng trên mô hình công nghệ của Hệ thống thông quan tự động (NACCS) và Hệ thống hải quan thông minh (VCIS) của Nhật Bản, được điều chỉnh cho phù hợp với điều kiện Việt Nam. Đây là hệ thống do Nhật Bản viện trợ không hoàn lại nhằm hiện đại hóa hải quan.
Hai hệ thống VNACCS/VCIS được kỳ vọng sẽ giúp cải thiện môi trường kinh doanh nhờ giảm chi phí và thời gian làm thủ tục thông quan cũng như giảm chi phí hành chính. Hệ thống còn giúp tăng cường liên kết giữa Việt Nam với các nền kinh tế khác trên thế giới, thông qua cơ chế một cửa ASEAN.
HUY HÀ