Qua đó giúp doanh nghiệp không phải phụ thuộc vào cán bộ thuế và giảm thiểu những khó khăn cho người nộp thuế. Cụ thể, cơ quan này đặt mục tiêu tháng 11-2016 sẽ triển khai thí điểm hoàn thuế điện tử tại năm tỉnh, thành gồm: Hà Nội, TP.HCM, Đồng Nai, Hải Phòng và Bình Dương. Sang tháng 12 sẽ mở rộng thêm tám tỉnh, thành.
Tuy nhiên, đại diện Tổng cục Thuế cho biết việc người nộp thuế và cơ quan thuế có tiếp xúc với nhau hay không còn phụ thuộc vào mức độ tuân thủ của người nộp thuế và số liệu kê khai. Nếu hồ sơ ngay từ kê khai không đúng, trong quá trình gửi hồ sơ đề nghị hoàn có những vấn đề tuân thủ của người nộp thuế không tốt, dẫn đến cơ quan thuế có quyết định kiểm tra tại doanh nghiệp thì không thể tránh khỏi cơ quan thuế xuống trực tiếp doanh nghiệp.