Theo văn bản này, ông Thư đã có các hành vi vi phạm: Để Trường ĐH GTVT TP.HCM kết hợp với Công ty Cổ phần Đào tạo - Xây dựng và Phát triển nguồn nhân lực Sáu đào tạo cao học ngoài trường sai với quy định của Bộ GD&ĐT; bổ nhiệm bà Nguyễn Thị Xuân Thủy giữ chức vụ phó giám đốc Trung tâm Ngoại ngữ trong khi bà Thủy chưa phải là viên chức.
Trong hai năm 2015 và 2016, ông Thư có sai sót trong công tác quản lý đào tạo cao học, để một số giảng viên dạy cao học ngoài trường khi chưa được Bộ GD&ĐT cho phép…