Ngày 7-9, theo Cổng thông tin Chính phủ, Phó Thủ tướng thường trực Chính phủ Trương Hòa Bình đã yêu cầu Bộ GTVT chỉ đạo Thanh tra Bộ này chuyển kết quả xác minh về tiêu cực, tham nhũng xảy ra tại Cục Đường thủy nội địa Việt Nam đến Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an để điều tra, xử lý theo quy định của pháp luật.
Những phiếu thu “quỹ đen” từ các công ty trúng thầu.
Trước đó, từ ngày 1 đến ngày 3-8, báo Pháp Luật TP.HCM có đăng loạt bài "Nghi vấn quỹ đen ở Cục Đường thủy nội địa Việt Nam" phản ánh việc để được thi công những gói thầu do Cục đường thủy nội địa Việt Nam làm chủ đầu tư, những công ty trúng thầu phải trích nộp một phần tiền trở lại cho chủ đầu tư với tỷ lệ nhất định trên giá trị trúng thầu khoảng từ 5% đến 20%.
Ngay sau đó Phó phó thủ tướng chỉ đạo Bộ trưởng Bộ GTVT xác minh xử lý nghiêm cán bộ sai phạm.
Ngày 29-8, Bộ GTVT đã kết luận sai phạm vụ việc này. Theo đó, Bộ đã yêu cầu Cục đường thủy nộp hơn 406 triệu đồng, ông Phạm Văn Thông, nguyên GĐ Ban quản lý dự án ở Cục đường thủy Nội địa nộp lại hơn 4,3 tỉ đồng. Đây là tiền 'quỹ đen' mà các công ty trúng thầu phải nộp.
Xét báo cáo của Bộ Giao thông vận tải về kết quả xác minh "dấu hiệu lập quỹ đen ở Cục Đường thủy nội địa Việt Nam", Phó Thủ tướng Trương Hòa Bình yêu cầu Bộ GTVT chỉ đạo Thanh tra Bộ chuyển kết quả xác minh nội dung phản ánh của báo Pháp Luật TP.HCM kèm theo các tài liệu chứng cứ liên quan đến Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an (đồng gửi Viện KSND Tối cao) để điều tra, xử lý theo quy định của pháp luật và báo cáo kết quả lên Thủ tướng Chính phủ.