Theo đó, có ý kiến cho hay trong thực tế các cá nhân, tổ chức thường thực hiện hai hành vi cùng lúc, đó là “lấn, chiếm đất” và “xây dựng công trình trên đất”. Do đó, đề nghị bổ sung điều khoản về mức xử phạt, biện pháp khắc phục hậu quả khi xử lý hai hành vi nói trên, đồng thời quy định trình tự nếu áp biện pháp cưỡng chế (phá bỏ công trình trên đất và trả lại đất đã lấn, chiếm).
Tổng cục Quản lý đất đai cho hay trường hợp lấn, chiếm đất mà xây dựng công trình trái phép thì ngoài việc xử phạt theo nghị định này còn bị xử phạt theo quy định tại Nghị định 139/2017 về xử phạt vi phạm trong trật tự xây dựng. Do đó không bổ sung quy định xử phạt hành vi xây dựng công trình trên đất vì dẫn đến chồng chéo trong xử phạt vi phạm giữa nghị định này với Nghị định 139.