Bên cạnh đó, những bệnh mới nổi ở lứa tuổi học đường do gánh nặng học tập, điều kiện xã hội, kinh tế phát triển làm gia tăng tỉ lệ thừa cân, béo phì ở học sinh (15%-40%); rối loạn tâm thần học sinh (7%-25%); tỉ lệ mắc bệnh răng miệng cao (60%-95%). Đặc biệt gần đây nổi lên vấn nạn bạo lực học đường ở nhiều nơi. Số học sinh có ý định tự tử tăng cao (16,9%), trong đó 21,8% phải đến bác sĩ điều trị; 4,7% học sinh hút thuốc lá và 22,5% học sinh đã từng uống rượu say.
Cục Y tế dự phòng cảnh báo điều kiện vệ sinh trường học nhiều nơi, nhất là ở khu vực nông thôn, vùng núi, vùng sâu vùng xa chưa đáp ứng yêu cầu dẫn đến nguy cơ xảy ra dịch bệnh và mắc các bệnh tật học đường gia tăng.