Căn cứ kết quả điều tra, Cơ quan ANĐT - Bộ Công an khởi tố vụ án hình sự chiếm đoạt tài liệu bí mật nhà nước xảy ra tại thành phố Hà Nội và các tỉnh, thành phố khác.
Đồng thời, ra quyết định khởi tố bị can, lệnh bắt bị can để tạm giam, lệnh khám xét chỗ ở đối với ông Nguyễn Văn Yên, nguyên Phó Trưởng ban Ban Nội chính Trung ương (58 tuổi, ở Phường Phú Thượng, quận Tây Hồ, TP Hà Nội) để điều tra về tội chiếm đoạt tài liệu bí mật nhà nước.
Sau khi VKSND tối cao phê chuẩn, Cơ quan ANĐT Bộ Công an đã thực hiện tống đạt quyết định khởi tố bị can, thi hành lệnh bắt bị can để tạm giam, khám xét chỗ ở đối với bị can Nguyễn Văn Yên.
Hiện, vụ án đang được Cơ quan ANĐT Bộ Công an tiếp tục điều tra, làm rõ để xử lý theo quy định của pháp luật.